Książka J. Wilanowskiego „Honor, zdrada, kaźń... Afery Polski Podziemnej 1939-1945” to zbiór szkiców popularnonaukowych o wciąż słabo poznanych aspektach dziejów organizacji konspiracyjnych w okupowanej Polsce.

W oparciu o materiały archiwalne, wspomnienia i wyniki badań wielu historyków autor analizuje różne mało znane, ciekawe i często tajemnicze wydarzenia. Szczególnie interesują go metody, zakres i skala penetracji Polski Podziemnej przez niemiecką Tajną Policje Polityczną (Gestapo), Służbę Bezpieczeństwa SS (SD) i Abwehrę (wywiad i kontrwywiad wojskowy). Oto niektóre tematy podjęte przez autora:
•przejęcie części archiwum polskiego wywiadu (II Oddziału Sztabu Głównego WP)
we wrześniu 1939 r. przez kpt. Bulanga z Abwehry
•czy szef sztabu Związku Walki Zbrojnej płk J. Albrecht sypał?
•iloma agentami dysponowało Gestapo w okupowanej Polsce?
•kim był Karol Englisch?
•gdzie i kiedy zmarł aktor Eugeniusz Bodo?
•afera „Nadwywiadu” i Józef Hammer-Baczewski
•inż. Stefan Witkowski i siatka „Muszkieterów”
•dlaczego zginął „Biegacz”?
•SS-Haptsturmführer Paul Fuchs i Narodowe Siły Zbrojne
•tajemnica agentki Gestapo „Wandy Zemsty”
•rozbicie „Osy”/”Kosy-30”, oddziału dyspozycyjnego Kierownictwa Dywersji KG AK
•„mord założycielski” w kierownictwie Polskiej Partii Robotniczej (bracia mołojcowi i M. Nowotko)
•żydowscy agenci Gestapo – organizacja „Żagiew”, Dawid Gertler, „Lolek” Skosowski, Józef Diamand, Roman Słania i inni
•afera „Hotelu Polskiego”
•tajemnice organizacji „Miecz i Pług”